在生命科学研究中，理解蛋白质如何彼此协作，是揭示信号转导、转录调控、疾病机制等核心生物学过程的基础。免疫沉淀（Immunoprecipitation, IP）与共免疫沉淀（Co-immunoprecipitation, Co-IP）是研究蛋白互作网络的经典工具，尤其在蛋白组学和细胞信号通路研究中占据重要地位。虽然两者名称相似，实验操作流程也有一定重叠，但它们在实验目的、技术原理和数据解读方式上存在本质区别。

一、什么是免疫沉淀（IP）？

免疫沉淀是一种利用特异性抗体从复杂样本中富集目标蛋白的技术。

1、基本原理

• 使用特异性抗体识别目标蛋白。
• 通过蛋白A/G磁珠或琼脂糖珠将抗体-蛋白复合物“拉出”。
• 洗脱后进行后续检测，如Western blot、SDS-PAGE或质谱分析。

2、应用场景

• 纯化单一蛋白以进行功能研究。
• 富集低丰度蛋白。
• 分析蛋白翻译后修饰（如磷酸化、泛素化）。
• 蛋白鉴定与定量前的预处理。

二、什么是共免疫沉淀（Co-IP）？

共免疫沉淀是在免疫沉淀的基础上，进一步探索蛋白与其结合伙伴（binding partners）之间互作的技术。

1、核心逻辑

如果A蛋白与B蛋白在细胞中形成复合物，通过抗-A抗体免疫沉淀A蛋白时，B蛋白也会被“顺带拉下”。

2、关键点

• Co-IP不是为了获取A蛋白本身，而是为了确认或发现其互作蛋白。
• 对于非共价、瞬时或弱结合的互作，Co-IP对实验条件（如缓冲液、洗涤强度）更为敏感。

3、应用场景

• 验证蛋白-蛋白相互作用（PPI）。
• 探索信号通路中的上下游相互关系。
• 结合质谱进行蛋白互作组（interactome）分析。
• 药物作用靶点筛选。

三、IP与Co-IP的核心区别

可以看出，免疫沉淀更像是一种“精准捕捉”目标蛋白的工具，而共免疫沉淀则是“挖掘社交关系”的方法，两者各有侧重，常根据研究目的灵活选用。

四、Co-IP + 质谱：探索互作网络的黄金组合

近年来，随着高分辨率质谱技术的发展，共免疫沉淀结合质谱（Co-IP-MS）成为系统研究蛋白互作网络的强大手段。

在百泰派克生物科技，我们整合了高特异性抗体筛选平台与Orbitrap Exploris™ 480质谱系统，建立了标准化的Co-IP-MS技术服务流程，支持：

1、多样本并行处理。

2、蛋白互作谱深度挖掘。

3、丰度定量与可信度评估。

4、互作网络可视化输出。

这种模式不仅适用于基础科研（如筛选转录因子的调控因子），也广泛应用于新药靶点识别、疾病生物标志物开发等转化研究。

五、技术选择建议：何时用IP？何时选Co-IP？

选择哪种技术，取决于您的研究目的：

1、想要富集某一蛋白进行定量或修饰分析？ —— 使用免疫沉淀（IP）

2、关注蛋白是否与某种蛋白发生互作？ —— 选择共免疫沉淀（Co-IP）

3、希望系统挖掘互作网络，寻找潜在调控因子？ —— 推荐Co-IP + LC-MS/MS

在具体实验中，两者也可以串联使用，例如先通过IP富集目标蛋白，再进行互作验证，实现从蛋白本体到互作机制的完整链路追踪。

免疫沉淀与共免疫沉淀是蛋白组学研究中不可或缺的工具。一个细节优化的实验流程，往往比技术本身更能决定数据的可信度与科学价值。

在百泰派克生物科技，我们不仅提供标准化的IP与Co-IP实验服务，更支持蛋白互作组的整体解决方案设计，包括：

1、抗体筛选与验证。

2、实验优化与定制。

3、高通量质谱鉴定。

4、生信分析与网络构建。

欢迎联系百泰派克生物科技了解更多蛋白互作研究服务，获取一对一实验方案建议。

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百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

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